Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC4Q9UBN4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms