Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms