Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms