Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COMMD8Q9NX08 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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