Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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