Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRHQ9HD43 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRHQ9HD43 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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