Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEMA4CQ9C0C4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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