Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRINP2Q9C0B6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms