Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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