Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms