Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms