Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms