Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT17Q9BSW7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms