Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms