Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms