Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms