Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms