Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms