Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCZQ96LD1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCZQ96LD1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCZQ96LD1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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