Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms