Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms