Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFXN5Q8TD22 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFXN5Q8TD22 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms