Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms