Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC103Q8IW40 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms