Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PBRM1Q86U86 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBRM1Q86U86 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms