Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APTXQ7Z2E3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms