Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTOP1Q7RTM1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms