Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms