Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.1 ms