Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPPQ6IPU0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms