Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD40Q6AI12 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms