Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms