Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms