Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms