Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms