Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms