Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms