Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms