Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L6Q3SYB3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms