Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms