Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C17orf58Q2M2W7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C17orf58Q2M2W7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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