Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms