Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms