Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPROQ16827 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPROQ16827 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPROQ16827 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPROQ16827 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PTPROQ16827 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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