Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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