Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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