Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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