Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms