Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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