Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms